Sulla prestigiosa rivista Bioinformatics è stato pubblicato un lavoro scientifico del dott. Giuseppe Agapito, ricercatore a tempo determinato di Sistemi di Elaborazione delle Informazioni all’Università Magna Graecia di Catanzaro, dal titolo BioPAX-Parser: parsing and enrichment analysis of BioPAX pathways.
Il lavoro, svoltosi nell’ambito di una collaborazione scientifica tra il Laboratorio di Bioinformatica dell’Ateneo ed il gruppo di ricerca del prof. Igor Jurisica del Department of Medical Biophysics and Computer Science dell’Università di Toronto, Canada, presenta un nuovo software bioinformatico, BioPAX Parser, per l’arricchimento funzionale e l’analisi di pathways biologici codificati secondo lo standard BioPax.
Il software BiP consente di utilizzare contemporaneamente ed integrare i dati provenienti da diversi pathways database (ad es. Reactome, PathwayCommons) consentendo di superare gli attuali software che analizzano i dati di un unico pathways database.
Il nuovo software bioinformatico, rilasciato gratuitamente alla comunità scientifica, è utilizzato nell’ambito di alcune ricerche congiunte con l’Università di Toronto e potrà costituire una opportunità per i colleghi di area biologica e medica coinvolti nello studio di pathways biologici.
Tale lavoro scientifico dimostra inoltre come le tecniche avanzate di programmazione sviluppate presso l’Università di Catanzaro, applicate agli algoritmi per l’analisi dei pathways biologici, possano consentire di realizzare software bioinformatici innovativi e di valenza internazionale. (rcz)
